运-20运送机的第一个使命是高效、安全地运送人员与物资。因而，其防护思维与作战飞机有本质区别：在执行使命前，使命规划系统会精心挑选相对安全的飞翔航线和高度，尽或许的防止飞越敌方防空密布区域或抵触热门空域。这是最首要、最有用的防护办法；
运-20装备雷达告警接收机（RWR）：这套系统可以勘探到敌方雷达（包含地上防空雷达、火控雷达以及战斗机或无人机载雷达）的照耀，并向机组人员宣布警报，使其能及时采纳躲避动作；机载导弹迫临告警系统（MAWS）用于勘探来袭导弹（特别是红外制导的地空/空空导弹）的尾焰；
而运-20的定向红外对立系统（DIRCM）与搅扰弹是最要害的自动防护手法：红外搅扰弹（热焰弹）用于拐骗红外制导导弹。当MAWS或RWR判别有红外导弹来袭时，飞机会发射热焰弹，其高温热源会招引导弹，使其违背方针；箔条用于对立雷达制导导弹，构成雷达假方针；定向红外对立系统（DIRCM）一般是一个装置在机体上的激光发射器。当勘探到红外导弹来袭时，系统会发射调制过的激光束直接照耀导弹的导引头，使其致盲或失效，运-20作为21世纪规划的新锐机型，很大概率现已集成或预留装置DIRCM接口；
乌克兰战役、缅甸内战、非洲反恐等战役中，无人机进犯航空器并不只是停留在纸面上，而是各个装备安排活跃运用的战术，那么，运-20怎么维护本身呢？防护无人机是一个杂乱的课题，由于“无人机”包含的规模极广，从小型消费级无人机到大型高空长航时察打一体无人机，要挟等级彻底不同。运-20的防护战略也因要挟类型而异：
针对小型/微型无人机（“低慢小”方针）：这类无人机速度慢、雷达反射面积小，难以被发现。它们或许经过“蜂群”战术进行自杀式进犯，或对机场起降阶段的运-20构成要挟—现在，运-20本身很难有用应对这种要挟，首要依靠护航战斗机、随同飞翔的专用电子战飞机或预警机来担任勘探和铲除这些方针。运送机本身会优先采纳躲避动作。
运-20在机场的起降阶段（最软弱时），防护职责首要落在机场防空系统上。这包含：电子搅扰系统阻断无人机与控制站的联络，使其失能或迫降；激光兵器、微波兵器、防空炮、乃至训练有素的猛禽等，用于直接击落无人机；
假如运-20遇到中大型察打一体无人机（如MQ-9“死神”），这类无人机一般挂载有空空导弹或准确制导炸弹，具有必定的空战才能，要挟等级高。此刻，运-20肯定防止单独遭受（中心准则）。运-20不会在没有保护的情况下进入此类无人机活动的空域。所以，运-20的生计依靠于整个作战系统的支撑，例如由歼-10C、歼-16、歼-20等战斗机为运送机群供给护航，提早驱离或击落敌方无人机；预警机供给大规模的空情监督，提早发现远距离的无人机要挟，为机群和指挥中心供给预警；运-8/9渠道改装的电子战飞机对无人机的数据链和GPS导航系统来进行限制和搅扰，使其失效；
运-20的防护是一个“系统工程”。 它本身的防护系统（RWR， MAWS， DIRCM/搅扰弹）是一套坚实的“贴身警卫”，大多数都用在应对遽然呈现的、小规模的直接要挟。而面对像无人机进犯这样的系统性应战，其生计的重点是融入并依靠强壮的作战系统，经过情报、监督与侦查（ISR）、战斗机护航、电子战援助和紧密的使命规划，完成“御敌于国门之外”，从根本上防止堕入需求单独搏斗的险境。
这种“渠道+系统”的防护形式，也是当今世界各军事强国关于大型高价值空军渠道（如预警机、加油机、运送机）的规范做法。
